Anthropic afirma que Claude ha descubierto un sistema enzimático hasta ahora desconocido en el ADN de virus que infectan bacterias. Estudios anteriores ya habían registrado la enzima en su núcleo, pero parecen haber pasado por alto lo que la rodea.
Anthropic publicó los hallazgos el 23 de septiembre. Los hallazgos constituyen una prueba clave de que la IA ya puede detectar patrones que los expertos humanos pasaron por alto. Pero ¿qué significa exactamente este descubrimiento?
¿Por qué debería importarle a alguien fuera de un laboratorio?
Muchos descubrimientos que cambiaron la medicina comenzaron cuando un científico advirtió algo extraño en la naturaleza. El uso por parte de los científicos de enzimas de restricción, halladas en bacterias, ayudó a poner en marcha la industria biotecnológica.
Una enzima de una fuente termal de Yellowstone se convirtió en la base de la PCR. Ese método para copiar ADN sustenta hoy buena parte de las pruebas médicas modernas.
Claude ha dado ahora ese paso de advertir algo con solo una orientación general de los científicos de Anthropic. El CEO de Anthropic, Dario Amodei, sostiene que esto encaja en un patrón más amplio. En 2023, los modelos de IA tenían dificultades con las matemáticas de secundaria.
Para finales de 2026, afirma, están empezando a resolver algunos de los problemas abiertos más difíciles del campo. Cree que la IA para la biología sigue una curva similar.
Si está en lo cierto, dice Amodei, un descubrimiento más rápido podría revelar nuevas dianas farmacológicas y nuevos tipos de tratamientos. No acortaría los ensayos clínicos, pero podría enviar muchos más candidatos prometedores a la cadena de desarrollo de fármacos.
Ya había escrito antes que la IA podría ayudar a curar la mayoría de las enfermedades en 5 a 10 años. Califica ese objetivo de apenas posible.
Por ahora, los científicos humanos siguen realizando cada experimento, y la función del nuevo sistema sigue siendo desconocida.
¿Qué es exactamente CRISPR?
Las bacterias sufren ataques constantes de virus llamados bacteriófagos, o fagos. Muchas bacterias se defienden con un sistema llamado CRISPR.
CRISPR funciona como un banco de memoria. Las bacterias almacenan fragmentos cortos de ADN de invasores pasados entre secuencias repetidas, y los científicos llaman a ese tramo un array (matriz).
Cada fragmento se copia en un trozo corto de ARN. Ese ARN guía luego a una proteína para localizar y cortar el ADN viral coincidente si el mismo virus regresa.
Los científicos advirtieron CRISPR como un patrón de repeticiones inusual en el ADN bacteriano. Más tarde aprendieron a introducir guías de ARN de su propio diseño, lo que hizo el sistema programable y lo convirtió en una herramienta de edición genética que hoy se usa en medicina.
¿Qué encontró Claude?
El sistema que encontró Claude se organiza en torno a otro tipo de enzima llamada transcriptasa inversa. Copia el ARN de vuelta a ADN y, según Anthropic, las bacterias emplean muchas de estas enzimas para combatir los virus.
Los investigadores ya habían registrado esta enzima concreta en un fago gigante, un virus inusualmente grande que infecta bacterias. Sin embargo, los estudios anteriores parecen haber pasado por alto las características que definen el sistema. Claude parece ser el primero en detectarlas.
Una es una proteína asociada cuya función aún nadie conoce. La otra es un largo array de repeticiones de ADN espaciadas de forma regular, dispuesto de manera muy similar a un array de CRISPR. CRISPR se encuentra sobre todo en bacterias, mientras que ART aparece principalmente en los fagos que las infectan.
Anthropic denomina a este conjunto de tres partes transcriptasas inversas asociadas a array (array-associated reverse transcriptases), o ART. El agente de Claude que lo detectó dejó constancia de su sorpresa mientras leía el ADN en bruto.
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¿Cómo lo encontró el agente de Claude?
El agente fue uno de los aproximadamente 950 agentes de Claude que trabajaban en la misma búsqueda. Los científicos de Anthropic lo pusieron en marcha con un solo prompt, pidiendo a Claude que encontrara nuevas transcriptasas inversas en una enorme base de datos de ADN.
A lo largo de 21 horas, los agentes usaron 210 millones de tokens, los pequeños fragmentos de texto que procesan los modelos de IA. Reunieron más de 200.000 transcriptasas inversas y seleccionaron 3.500 nuevos sistemas candidatos.
Luego los agentes redujeron esa lista a los 20 candidatos más convincentes y redactaron informes para su revisión por humanos. Según Anthropic, ese tipo de análisis puede llevarle a un científico experto de semanas a meses.
“Mientras rastreaba la secuencia de ADN en bruto cerca de la RT, el agente exclamó: “[El ADN junto a la RT] es espectacular: puedo ver a simple vista un array de repeticiones en tándem … ¿eso es un array de repeticiones … similar a CRISPR?!”
El agente detrás de ART trabajó en gran medida como lo haría un científico humano. Contó las repeticiones, midió su espaciado, comparó la disposición con sistemas conocidos y revisó la literatura en busca de informes previos.
Los científicos de Anthropic solo aportaron el prompt e hicieron ellos mismos el trabajo de laboratorio. Los agentes usaron su propio criterio para elegir qué pistas valía la pena seguir.
Ese trabajo de laboratorio se realizó en las instalaciones de la empresa en el Área de la Bahía, que no manipula patógenos que infectan a los humanos.
¿Qué ha encontrado el laboratorio hasta ahora?
Los primeros experimentos en ese laboratorio ofrecen una pista temprana sobre cómo podría funcionar ART. El equipo descubrió que el array de repeticiones de ART se transforma en un conjunto de ARN cortos diferenciados.
Eso recuerda a CRISPR, donde cada ARN corto actúa como una guía que apunta el sistema hacia una diana. Anthropic afirma que el resultado sugiere que algo parecido podría estar ocurriendo con ART.
La combinación de rasgos de ART es además poco común. Según Anthropic, solo un puñado de otros sistemas conocidos la comparten.
Todos ellos son programables y pueden actuar sobre el ADN, por ejemplo, cortándolo, copiándolo o pegándolo. Además de CRISPR, varios se están desarrollando ya como herramientas.
Sin embargo, Anthropic no ha demostrado que ART pueda hacer nada de esto. La empresa dice que aún no conoce la función principal del sistema y que hay más experimentos en marcha.
¿Qué opina el CEO de Anthropic?
Amodei, director ejecutivo de Anthropic, dijo en X que la empresa sospecha que ART podría ser un nuevo mecanismo de edición genética. En
“Es fácil descartar esto como algo puntual o una curiosidad, pero hemos visto repetidamente un patrón en el que el rendimiento de la IA en nuevos dominios intelectuales pasa de débil a sobrehumano en cuestión de unos pocos años”, afirmó.
Amodei señaló que un equipo de Stanford encontró hace poco un sistema de transcriptasa inversa con un array no codificante. Según él, en algunos aspectos es similar a ART, pero ambos evolucionaron de forma independiente.
¿Es este el próximo CRISPR?
Feng Zhang, pionero de CRISPR en el MIT y el Broad Institute, revisó el preprint, un artículo preliminar sin revisión por pares. Calificó los arrays de repeticiones de ARN de intrigantes y dignos de mayor investigación.
Kevin Blake, microbiólogo de la Facultad de Medicina de la Universidad de Washington, se mostró más escéptico. Dijo a Al Jazeera que CRISPR en la naturaleza es muy distinto de CRISPR, la tecnología.
También señaló que innumerables secuencias similares a CRISPR siguen sin catalogar, porque aún quedan millones de especies bacterianas por estudiar.
“No hay nada que indique que esto sea un rival de CRISPR-la-tecnología, ni que pueda convertirse en ningún tipo de aplicación terapéutica o práctica”, comentó.
Anthropic afirma que hay más experimentos en marcha para averiguar cómo funciona ART. Los resultados deberían mostrar si sus repeticiones apuntan a una nueva herramienta programable o a una rareza de la biología de los fagos.
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Fuente: BeInCrypto
